El Congreso fue organizado por la Mesa Directiva 2000-2002, presidida por la Dra. Lilia Núñez Orozco, y la eficaz colaboración del Comité Científico constituído por ocho distinguidos miembros de la academia. Las actividades académicas se iniciaron el martes 30 de octubre con la Primera Reunión de la Asociación Mexicana de Enfermedad Vascular Cerebral cuyo presidente, el Dr. Fernando Barinagarrementería, organizó un programa enfocado principalmente a los avances en el tratamiento de la isquemia y la hemorragia cerebrales.

Todas las conferencias del programa estuvieron a cargo de profesores invitados extranjeros. El miércoles 31 de octubre se efectuaron tres cursos pre-congreso: Muerte Cerebral, coordinado por el Dr. Miguel Angel Macías Islas; Utilidad Clínica de los Potenciales Evocados, organizado por la Sociedad Mexicana de Neuro fisiología Clínica y coordinado por el Dr. Noel Isaías Plascencia Alvarez; Neurología Para No Neurólogos, coordinado por el Dr. Guillerm o Albert Meza. Estos cursos fueron impartidos por miembros de la Academia Mexicana de Neurología. Con el patrocinio de los Laboratorios Abbott se efectuó, además, el simposio Avances en el Tratamiento de la Epilepsia con Valproato.